2001 - Implantação do Departamento de Desenvolvimento Humano e Reabilitação, vinculado ao Curso de Fonoaudiologia.
2002 - Toma posse como diretor da FCM a Profa. Dra. Lílian T. Lavras Costallat para o período de 2002 a 2006. A FCM possui 427 docentes (288 em RDIDP; 96 em RTC; 15 em RTP e 28 docentes na carreira especial lotados no CEPRE). Os funcionários somam 481 (361 da Unicamp e 120 da Funcamp). Um levantamento, efetuado no 1º. Semestre de 2002, apontou um total de 2129 alunos matriculados: 793 no curso de graduação (642 em medicina e 151 em enfermagem); 1273 no curso de pós-graduação (809 em mestrado e 464 em doutorado) e 63 no curso de especialização.
Tem início o curso de fonoaudiologia ligado ao CEPRE.
Em 02/07 inaugurado a ampliação do Departamento de Enfermagem, perfazendo uma área de 1.200m²
2003 - Comemoração dos 40 anos da Faculdade de Ciências Médicas. BOMBA
É inaugurado o Pólo de Educação Permanente em Saúde Leste Paulista.
2004 - Implantação do Curso Multidisciplinar de Farmácia. Concedido ao Prof. Dr. Bernardo Beiguelman o Título de Prof. Emérito em 30/10/2004. Hemocentro completa 20 anos Prof. Cármino Antonio de Souza, recebe o prêmio Zeferino Vaz Alunos da FCM recebem o 21º Prêmio Jovem Cientista – 2004 na categoria “Graduado”, o segundo lugar ficou para a doutoranda Adriana da Silva Santos Duarte, com um estudo que demonstrou os primeiros resultados de pesquisas com o gene PP2500 presente nos pacientes com o câncer mieloma múltiplo. Aluno do quinto ano de Medicina, Samuel de Souza Medina também foi contemplado. Obteve a segunda colocação na categoria “Estudante de Ensino Superior”. Medina estudou a expressão da proteína Formina leucocitária humana nas células normais e tumorais.
2005 - Hospital das Clínicas completa 20 anos no campus Unicamp em outubro. Professor Fernando Ferreira Costa, é empossado como vice reitor no período de 2005-2008. Enfermagem da FCM perde Dalva Darcoleto Silva Pereira que participou da criação e implantação do Departamento de Enfermagem da FCM, onde ensinou a profissão para diversas gerações de enfermeiros. FCM gradua primeiras turmas de especialização em medicina familiar. HES lança pedra fundamental de área de ensino e pesquisa.
2006 - O Departamento de Neurologia comemora 40 anos.
FCM inaugura a clínica de Fonouadiologia.
O professor José Antonio Rocha Gontijo toma posse como diretor da FCM no período de 2006 – 2009.
2007 - FCM perde o prof. Cleber Evandro Teixeira que integrava o corpo docente do Departamento de Farmacologia da Universidade. Graduou-se no ano de 1995 em Farmácia Bioquímica pela Universidade Estadual Paulista "Júlio de Mesquita Filho" (Unesp), de Araraquara. Concluiu o mestrado pela Unicamp em 1997 e o doutorado pela USP em 2001. Realizou pós-doutoramento no Brasil (2001-2003) e nos Estados Unidos (2003-2006). Em setembro de 2006 chegou a professor assistente doutor no Departamento de Farmacologia da Unicamp.
2009 - Primeira turma do curso de Farmácia descerra painel de fotos.
FCM cria serviço de Ouvidoria.
Unicamp está entre 'Os Mais Admirados da Medicina de 2009'.
Novas obras são inauguradas no campus; FCM inaugura prédios de Habilidades e Pós-Graduação.
FCM inaugura Espaço Gourmet.
Medicina propõe ciação de curso de graduação para formação de médico-pesquisador.
FCM entrega prêmio de incentivo ao ensino de graduação.
O papel de Pinotti na consolidação da Unicamp.
Pesquisa da FCM abre perspectivas para o tratamento da obesidade e do diabetes.
AME de Piracicaba será administrado pela Faculdade de Ciências Médicas.
Salvando bebês. Ainda no útero.