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O Programa de Pós-Graduação em Ciências da Cirurgia possui duas áreas de concentração, cada qual com suas linhas de pesquisas específicas:
Área de Concentração em Fisiopatologia Cirurgica (AC):
1. Aspectos biopsicossociais e qualidade de vida antes e/ou após procedimentos cirúrgicos: investigação de qualidade de vida em pacientes submetidos a terapias cirúrgicas.
Docentes Orientadores:
Agrício Nubiato Crespo - agriciocrespo@gmail.com 
Almiro José Machado Junior - almiromachadophd@gmail.com
Arthur Menino Castilho - arthurcastilho@gmail.com
Carlos Arturo Levi D’Ancona – cdancona@uol.com.br
Carlos Takahiro Chone - cchone@icloud.com
Cássio Luis Zanettini Riccetto - cassioriccetto@gmail.com
Elaine Cristina de Ataíde - elainebataide@gmail.com
Elcio Shiyoiti Hirano - hirano.es@gmail.com
Elinton Adami Chaim – chaim@hc.unicamp.br
Eulália Sakano - eulalia.s@terra.com.br
Ilka de Fátima Santana Ferreira Boin – ilkaboin@gmail.com
Luiz Roberto Lopes – lopeslr@fcm.unicamp.br
Maurício Etchebehere – maue@unicamp.br
Wagner Eduardo Matheus – wematheus@uol.com.br
2. Desenvolvimento e avaliação de modelos em ensino médico em cirurgia na graduação e na pós-graduação: avaliação do ensino médico em cirurgia proposta em vários tipos de apresentação para facilitação e melhoria da acessibilidade do aprendizado.
Docentes Orientadores:
Ana Terezinha Guillaumon – atguillaumon@gmail.com.
Elcio Shiyoiti Hirano - hirano.es@gmail.com
Eulália Sakano - eulalia.s@terra.com.br
Gustavo Pereira Fraga – fragagp2008@gmail.com
3. Desenvolvimento e avaliação de novas técnicas cirúrgicas – Modelos clínicos e experimentais: desenvolvimento e avaliação de novas técnicas cirúrgicas.
Docentes Orientadores:
Alberto Cliquet Junior – cliquet@fcm.unicamp.br
Arthur Menino Castilho - arthurcastilho@gmail.com
Elinton Adami Chaim – chaim@hc.unicamp.br
Ilka de Fátima Santana Ferreira Boin – ilkaboin@gmail.com
Luiz Roberto Lopes – lopeslr@fcm.unicamp.br
Maria de Lourdes Setsuko Ayrizono - luayrizono@terra.com.br
Maurício Etchebehere – maue@unicamp.br
Nelson Adami Andreollo – nandreollo@hotmail.com
Wu Feng Chung – wufengchung@gmail.com
4. Desenvolvimento e avaliação de novas técnicas de anestesia e de ventilação mecânica: modelos clínicos e experimentais: desenvolvimento e avaliação de novas técnicas de ventilação mecânica experimentais e em pacientes críticos.
Docentes Orientadores:
Alfio José Tincani – alfio@tincani.net ou tincani@unicamp.br
Antonio Luis Eiras Falcão – falcao@unicamp.br
Lígia dos Santos Roceto Ratti - ligiasroceto@hc.unicamp.br
Luiz Cláudio Martins – lclaudio@fcm.unicamp.br
Marcos Mello Moreira – marcosmm@fcm.unicamp.br
5. Estudo de mecanismos e aplicabilidade de substâncias farmacológicas em cirurgia: estudo de mecanismos e aplicabilidade em cirurgia de substâncias farmacológicas visando a replicação de estudos ou mesmo a descoberta de novas aplicações para validade externa ou interna.
Docentes Orientadores:
Marcos Mello Moreira – marcosmm@fcm.unicamp.br
Wagner José Fávaro - wjfavaro@gmail.com
6. Estudo dos distúrbios da movimentação e locomoção associados a distúrbios neuromusculares e/ou osteometabólicos e tetraplegia: estudo dos distúrbios da marcha associados a distúrbios neuromusculares e/ou osteometabólicos e tetraplegia, observando a locomoção, marcha, movimentação em pacientes paraplégicos ou com lesões medulares.
Docentes Orientadores:
Alberto Cliquet Junior – cliquet@fcm.unicamp.br
Maurício Etchebehere – maue@unicamp.br
William Dias Belangero – belangerowd@gmail.com
7. Estudo dos mecanismos de trauma, suas consequências fisiopatológicas na avaliação do paciente crítico: avaliação clínico epidemiológica dos mecanismos de trauma e suas consequências anatômicas e fisiológicas epatológicas levando-se em consideração os pacientes críticos ou o estado crítico a que estes pacientes são submetidos, incluindo modelo experimental.
Docentes Orientadores:
Alberto Cliquet Junior – cliquet@fcm.unicamp.br
Antonio Luis Eiras Falcão – falcao@unicamp.br
Elcio Shiyoiti Hirano - hirano.es@gmail.com
Gustavo Pereira Fraga – fragagp2008@gmail.com
William Dias Belangero – belangerowd@gmail.com
8. Modelos clínicos e epidemiológicos de avaliação de transplantes de órgãos sólidos e tecidos relacionados ou não aos aspectos imunológicos: modelos clínicos e epidemiológicos de avaliação de transplantes abdominais, cardíacos e pulmonares, procurando abranger todas as áreas relacionadas à cirurgia de transplantes.
Docentes Orientadores:
Elaine Cristina de Ataíde - elainebataide@gmail.com
Ilka de Fátima Santana Ferreira Boin – ilkaboin@gmail.com
9. Modelos clínicos e experimentais de avaliação das alterações de motilidade visceral e esfincteriana: investigação por métodos clínicos e experimentais das alterações de motilidade visceral e esfincteriana.
Docentes Orientadores:
Carlos Arturo Levi D’Ancona – cdancona@uol.com.br
Cláudio Saddy Rodrigues Coy – claudiocoy@gmail.com
Cássio Luis Zanettini Riccetto - cassioriccetto@gmail.com
Nelson Adami Andreollo – nandreollo@hotmail.com
Simone Botelho Pereira – simone.botelho@unifal-mg.edu.br
Em vigor a partir de 2018 - Área de Concentração em Cirurgia Translacional (AD):
10. Desenvolvimento e aplicabilidade das técnicas de diferenciação em terapia celular: investigação sobre o uso de terapia celular em doenças cirúrgicas.
Docentes Orientadores:
Ângela Cristina Malheiros Luzo – luzo@unicamp.br ou angela.luzo@gmail.com
Wagner José Fávaro - wjfavaro@gmail.com
William Dias Belangero – belangerowd@gmail.com
11. Desenvolvimento, avaliação e aplicabilidade de biomateriais: desenvolvimento e avaliação de biomateriais visando sua aplicabilidade na prática cirúrgica.
Docentes Orientadores:
Ângela Cristina Malheiros Luzo – luzo@unicamp.br ou angela.luzo@gmail.com
Cássio Luis Zanettini Riccetto – cassioriccetto@gmail.com
12. Modelos clínicos, experimentais e epidemiológicos de avaliação das doenças inflamatórias gastrointestinais: investigação sobre os aspectos clínicos e epidemiológicos das doenças inflamatórias gastrointestinais.
Docentes Orientadores:
Cláudio Saddy Rodrigues Coy – claudiocoy@gmail.com
Maria de Lourdes Setsuko Ayrizono - luayrizono@terra.com.br
Mário Roberto Maróstica Junior - mmarosti@unicamp.br
Raquel Franco Leal – rafranco.unicamp@gmail.com
13. Modelos clínicos, experimentais e epidemiológicos de avaliação do tratamento cirúrgico dos tumores sólidos: investigação sobre os aspectos clínicos, experimentais e epidemiológicos do tratamento cirúrgico dos tumores sólidos e sua aplicabilidade.
Docentes Orientadores:
Alfio José Tincani – alfio@tincani.net ou tincani@unicamp.br
Cláudio Saddy Rodrigues Coy – claudiocoy@gmail.com
Carlos Takahiro Chone - cchone@icloud.com
Elaine Cristina de Ataíde - elainebataide@gmail.com
Ilka de Fátima Santana Ferreira Boin – ilkaboin@gmail.com
Luiz Roberto Lopes – lopeslr@fcm.unicamp.br
Nelson Adami Andreollo – nelsonan@fcm.unicamp.br
Wagner Eduardo Matheus – wematheus@uol.com.br
Wagner José Fávaro - wjfavaro@gmail.com
14. Modelos clínicos e experimentais de diagnóstico e tratamento das moléstias cardiovasculares: investigação por métodos clínicos e experimentais do diagnóstico e tratamento das moléstias vasculares periféricas.
Docentes Orientadores:
Ana Terezinha Guillaumon – atguillaumon@gmail.com
Marcos Mello Moreira – marcosmm@fcm.unicamp.br
15. Modelos para estudo das alterações inflamatórias e metabólicas secundárias a procedimentos cirúrgicos: estudos dos processos de inflamação, cicatrização, avaliação metabólica que podem decorrer de procedimentos cirúrgicos tais como isquemia e reperfusão, infecção por atuação de mediadores inflamatórios.
Docentes Orientadores:
Everton Cazzo - notrevezzo@yahoo.com.br
Nelson Adami Andreollo – nelsonan@fcm.unicamp.br
Raquel Franco Leal – rafranco.unicamp@gmail.com
Código do Curso de Mestrado = 049
Código do Curso de Doutorado = 089
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